На побережье Средиземного моря климат субтропический, на остальной территории — тропический, пустынный.
Отдыхать в Египте можно круглый год, но все же с февраля по конец апреля ехать не рекомендуется, так как в феврале температура воздуха самая низкая в году, а в марте дует хамсин – неприятный сильный ветер из пустыни. В летние месяцы стоит температура воздуха очень высокая: начиная с мая в некоторые дни поднимается до 45°С. Однако благодаря низкой влажности даже такая температура довольно легко переносится. В августе жара начинает смягчаться, и к октябрю погода вновь становится прекрасной. А на Синайском полуострове, благодаря его возвышенности над уровнем моря и господствующим северо-восточным ветрам, а также на побережье Средиземного моря температура воздуха и летом остается в допустимых пределах (в среднем 26°С).
В зимние месяцы ветер, дующий со стороны пустыни, несет песок. С декабря по март температура воздуха составляет от 23 до 25 градусов тепла, но иногда по вечерам опускается до 6-7°С. Температура воды в Красном море в это время от 19 до 21 градусов.
Климат различается также в зависимости от региона: на севере страны средняя температура в январе составляет +11°С , в июле — +26°С; на юге, соответственно, +16°С и +34°С.
В конце зимы — начале весны на Средиземноморском побережье бывают короткие дождливые периоды. В остальное время погода в Египте ясная и солнечная.
Практически вся растительность сосредоточена в дельте Нила, нильской долине и оазисах. Наиболее распространенное дерево — финиковая пальма. Среди других растений: сикомор, тамариск, акация, кипарис, мимоза, миртовое дерево. Папирус, ранее росший в большинстве мест, теперь остался только на юге.
Из-за засушливого климата животных в Египте немного. В пустынях обитают газель, пустынная лисица, гиена, шакал, дикий осел, кабан, тушканчик, египетский мангуст. В древности в Ниле водилось большое количество крокодилов и гиппопотамов, теперь они обитают в верховьях Нила. Среди рептилий несколько видов ящериц и ядовитых змей, в том числе рогатая гадюка и кобра. В Египте, в основном в дельте Нила, обитает около 300 видов птиц, в том числе пеликан, фламинго, цапля, нектарница, иволга, эгретка, сокол, орел, стервятник. Большое количество насекомых, а в пустынных регионах — скорпионов. В Ниле и озерах региона дельты обитает около 100 видов рыб.